GuideRNA

Guide RNA, gRNA — это РНК, которые опосредуют вставки уридиновых нуклеотидов в мРНК у трипаносом в процессе редактирования РНК.^[1][2][3] gRNA закодированы отдельными районами генома кинетопласта.^[4]

Механизм действия

5'-конец gRNA гибридизуется с коротким районом нередактированной пре-мРНК, называемым якорной последовательностью, в то время как 3'-конец таких РНК является матрицей для редактирования. Многие gRNA не гибридизуются с якорной последовательностью первичного транскрипта, но гибридизуются с частично редактированным транскриптом. Поэтому редактирование пре-мРНК трипаносом начинается обычно около 3'-конца и продвигается к 5'-концу в ходе повторяющегося процесса, который требует наличия нескольких разных gRNA, которые последовательно связываются с якорной последовательностью частично редактированных участков. Остается не совсем понятным, для чего кинетопласты трипаносом используют столь усложенный механизм образования мРНК. Функции многих gRNA не изучены.^[5]

Примечания

1. ↑ Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK Complex management: RNA editing in trypanosomes // Trends Biochem Sci. — 2005. — Т. 30. — № 2. — С. 97-105.
2. ↑ Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL Editing machines: the complexities of trypanosome RNA editing // Cell. — 2002. — Т. 108. — № 4. — С. 435-438.
3. ↑ Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S Kinetoplastid RNA editing: complexes and catalysts // Curr Opin Chem Biol. — 1997. — Т. 1. — № 3. — С. 340-346.
4. ↑ Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S Small nucleolar RNAs that guide modification in trypanosomatids: repertoire, targets, genome organisation, and unique functions // Int J Parasitol. — 2004. — Т. 34. — № 4. — С. 445-454.
5. ↑ Stuart K, Panigrahi AK RNA editing: complexity and complications // Mol Microbiol. — 2002. — Т. 45. — № 3. — С. 591-596.

Литература

• Gurbachan S. Miglani RNAs: Their Processing and Function // Advanced Genetics. — CRC Press, 2002. — С. 257—259. — 665 с. — ISBN 0849324254
• Bruce Alberts RNA Editing Can Change the Meaning of the RNA Message // Molecular Biology of the Cell. — Garland Science, 2007. — С. 483—484. — 1601 с. — ISBN 0815341113
• Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA Evolution of RNA editing in trypanosome mitochondria // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2000. — Т. 97. — № 13. — С. 6986-6993. — Обзорная статья об эволюции редактирования РНК у Трипаносом на английском языке, находится в свободном доступе

См. также

Редактирование РНК