- GuideRNA
-
Guide RNA, gRNA — это РНК, которые опосредуют вставки уридиновых нуклеотидов в мРНК у трипаносом в процессе редактирования РНК.[1][2][3] gRNA закодированы отдельными районами генома кинетопласта.[4]
Содержание
Механизм действия
5'-конец gRNA гибридизуется с коротким районом нередактированной пре-мРНК, называемым якорной последовательностью, в то время как 3'-конец таких РНК является матрицей для редактирования. Многие gRNA не гибридизуются с якорной последовательностью первичного транскрипта, но гибридизуются с частично редактированным транскриптом. Поэтому редактирование пре-мРНК трипаносом начинается обычно около 3'-конца и продвигается к 5'-концу в ходе повторяющегося процесса, который требует наличия нескольких разных gRNA, которые последовательно связываются с якорной последовательностью частично редактированных участков. Остается не совсем понятным, для чего кинетопласты трипаносом используют столь усложенный механизм образования мРНК. Функции многих gRNA не изучены.[5]
Примечания
- ↑ Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK Complex management: RNA editing in trypanosomes // Trends Biochem Sci. — 2005. — Т. 30. — № 2. — С. 97-105.
- ↑ Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL Editing machines: the complexities of trypanosome RNA editing // Cell. — 2002. — Т. 108. — № 4. — С. 435-438.
- ↑ Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S Kinetoplastid RNA editing: complexes and catalysts // Curr Opin Chem Biol. — 1997. — Т. 1. — № 3. — С. 340-346.
- ↑ Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S Small nucleolar RNAs that guide modification in trypanosomatids: repertoire, targets, genome organisation, and unique functions // Int J Parasitol. — 2004. — Т. 34. — № 4. — С. 445-454.
- ↑ Stuart K, Panigrahi AK RNA editing: complexity and complications // Mol Microbiol. — 2002. — Т. 45. — № 3. — С. 591-596.
Литература
- Gurbachan S. Miglani RNAs: Their Processing and Function // Advanced Genetics. — CRC Press, 2002. — С. 257—259. — 665 с. — ISBN 0849324254
- Bruce Alberts RNA Editing Can Change the Meaning of the RNA Message // Molecular Biology of the Cell. — Garland Science, 2007. — С. 483—484. — 1601 с. — ISBN 0815341113
- Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA Evolution of RNA editing in trypanosome mitochondria // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2000. — Т. 97. — № 13. — С. 6986-6993. — Обзорная статья об эволюции редактирования РНК у Трипаносом на английском языке, находится в свободном доступе
См. также
Типы нуклеиновых кислот Азотистые основания Нуклеозиды Нуклеотиды РНК мРНК • тРНК • рРНК • антисмысловые • gRNA • микро • некодирующие • piwi-interacting • shRNA • малые интерферирующие • малые ядерные • малые ядрышковые • тмРНК
ДНК кДНК • Геном • msDNA • Митохондриальная
Аналоги Гликоль-нуклеиновая кислота[ru] • Замкнутая нуклеиновая кислота[ru] • ПНК • ТНК • Морфолино
Типы векторов Фазмиды[ru] • Плазмиды • Фаг лямбда • Космиды[ru] • Фаг P1[ru] • Фосмиды[ru] • Искусственная бактериальная хромосома[ru] • Искусственная дрожжевая хромосома[ru] • Искусственная человеческая хромосома[ru]
Аминокислоты · Пептиды · Белки · Углеводы · Нуклеотиды · Нуклеиновая кислота · Липиды · Терпены · Каротиноиды · Стероиды · Флавоноиды · Алкалоиды · Гликозиды · Иридоиды
Категории:- РНК
- Молекулярно-генетические процессы
Wikimedia Foundation. 2010.